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于長永(博導(dǎo))

日期:2025年09月25日 08:37來源: 作者:關(guān)注:

于長永,男,19812月,博士研究生,副教授,博士生導(dǎo)師。 11081

聯(lián)系方式

電子郵件:cyyneu@126.com

研究方向

1) 生物信息數(shù)據(jù)高效存儲與分析技術(shù)

2) 深度學(xué)習(xí)+AI賦能蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)

教育背景

2004.09-2009.07 威尼斯wnsr9778計算機軟件與理論 工學(xué)博士

2000.09-2004.07 威尼斯wnsr9778信息與計算科學(xué) 理學(xué)學(xué)士

工作履歷

2012.07-至今 威尼斯wnsr9778秦皇島分校計算機科學(xué)與技術(shù)專業(yè) 副教授

2009.07-2012.07 威尼斯wnsr9778秦皇島分校計算機科學(xué)與技術(shù)專業(yè) 講師

2011.08-2013.08 中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 博士后

學(xué)術(shù)兼職

國際期刊《BMC Bioinformatics,Journal of Supercomputing,IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》等審稿人。

科研情況

現(xiàn)主持重點項目子課題1項。曾主持中央高校基本科研業(yè)務(wù)費,主持國家自然科學(xué)基金青年基金,博士后基金各1項。主持威尼斯wnsr9778秦皇島分校校內(nèi)科技支撐項目1項。曾作為主要研發(fā)人員參加科技部重點研發(fā)項目1項,參加國家自然科學(xué)基金課題 5項,遼寧省自然科學(xué)基金和河北省自然科學(xué)基金項目各1項。參加秦皇島市科技計劃項目1項。以第一作者在SCI期刊《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》、《IEEE Transactions on Big Data》、《BMC Bioinformatics》、《Neurocomputing》、《Journal of Supercomputing》發(fā)表論文多篇。共發(fā)表論文40余篇,SCI檢索10余篇,EI檢索30余篇。發(fā)明專利1項。獲秦皇島市科學(xué)技術(shù)進步獎(二等獎)1次。參編教材1部。

學(xué)術(shù)成果

【代表性學(xué)術(shù)論文】

[1].Changyong Yu, Xuxian Zhou, Xinyao Chen, Haitao Ma, Yuhai Zhao. gShapeLnoc: A Graph Network Incorporating Shapelet Embedding Model for LncRNA Subcellular LocalizationIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2025.

[2].Changyong Yu, Dekuan Gao, Xu Guo, Haitao Ma, Yuhai Zhao Guoren Wang. dwMLCS: An Efficient MLCS Algorithm based on Dynamic and Weighted Directed Acyclic GraphIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2024. DOI: 10.1109/TCBB.2024.3431558.

[3].Changyong Yu, Yuhai Zhao, Chu Zhao, Jianyu Jin, Keming Mao, Guoren WangMiniDBG: a novel and minimal De Bruijn graph for Read MappingIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023. DOI: 10.1109/TCBB.2023.3340251.

[4].Yu Changyong, Ren Tianmei, Wenyu Li, Liu Huimin, Ma Haitao and Zhao Yuhai. BL: An Efficient Index for Reachability Queries on Large Graphs, IEEE Transactions on Big Data, 2023.

[5].Yu Changyong, Liu Huimin, Fazal Wahab, Ling Zihan, Ren Tianmei, Ma Haitao and Zhao Yuhai. Global Triangle Estimation Based on First Edge Sampling in Large Graph Streams, Journal of Supercomputing. 79(13): 14079-14116 (2023).

[6].Changyong Yu, Pengxi LinYuhai ZhaoTianmei RenGuoren Wang: A fast and efficient path elimination algorithm for large-scale multiple common longest sequence problems. BMC Bioinform.?23(1): 366 (2022).

[7].于長永, 李俊杰, 馬海濤, 趙宇海一種針對大規(guī)模Read Mapping的高效DBG索引方法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(自然科學(xué)版), 2023, 44(6): 770-776.

[8].Changyong Yu, Peng Liu, Yudi Liu, Haitao Ma, Yuhai ZhaoA Practical Stream data Cleaning Method based on Local Shape Feature. 2022 (Hangzhou), Asia Conference on Algorithms, Computing and Machine Learning.

[9].Yu Changyong, Zhao Yuhai, Zhao Chu, Ma Haitao and Wang Guoren. DiagAF: A More Accurate and Efficient Pre-Alignment Filter for Sequence Alignment. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, doi: 10.1109/TCBB.2021.3127879.

[10].Yu Changyong, Mao Keming, Zhao Yuhai, Chang Cheng, Wang Guoren. StLiter: A Novel Algorithm to Iteratively Build the Compacted de Bruijn Graph from Many Complete GenomesIEEE/ACMTransactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2021, Feb 14. doi: 10.1109/TCBB.2021.3062068. 

[11].Changyong Yu, Xin QiHaitao MaXin HeCuirong WangYuhai Zhao. LLR: Learning learning rates by LSTM for training neural networks[J]. Neurocomputing, 2020, 394.

[12].Changyong Yu, Xin HeHaitao MaXin QiJiarui LuYuhai Zhao. S-DenseNet: A DenseNet Compression Model Based on Convolution Grouping Strategy Using Skyline Method[J]. ACCESS, 2019, 183604.

[13].于長永,金建宇,劉鵬,趙宇海基于最小邊集的De Bruijn圖定位算法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報, 2022,43(2)153-159.

[14].于長永,王文涵,溫秀靜,趙宇海基于動態(tài)雙重前綴的模糊相似性連接算法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報,2022,43(3).

[15].馬海濤, 路家蕊, 于文鑫, 于長永線性區(qū)域數(shù)量與PLNN表達能力的相關(guān)性[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報, 2021, 42(2): 201-207.

[16].于長永,何鑫,祁欣,馬海濤GMSDenseNet基于組多結(jié)構(gòu)卷積的輕量級DenseNet [J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報,2020,41(1)12-16.

[17].于長永,李淼淼,趙楚,馬海濤一種新穎的編輯距離限制下的相似性確認算法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報,2019,40(11).1543-1548.

[18].于長永,高明柏祿一趙宇海一種帶有長度和位置約束的字符串索引方法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報,2018,39(7)959-963.

【專利】

于長永;趙楚;一種基于位運算和SIMD并行操作的字符串過濾方法, 2024-8-2, 中國, ZL 2020 1 0876431.X

講授課程情況

現(xiàn)講授計算機科學(xué)與技術(shù)專業(yè)《計算機數(shù)學(xué)基礎(chǔ)》和《群智能優(yōu)化技術(shù)》課程。曾經(jīng)講授計算機專業(yè)《知識發(fā)現(xiàn)與數(shù)據(jù)挖掘》、《數(shù)值分析》、《最優(yōu)化導(dǎo)論》、《并行計算》和《離散數(shù)學(xué)》等課程。

指導(dǎo)研究生情況

2013年指導(dǎo)計算機專業(yè)研究生,目前指導(dǎo)研一、二、三學(xué)生各3人,已指導(dǎo)畢業(yè)研究生20余人。

 

 


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