于長(zhǎng)永，男，1981年2月，博士研究生，副教授，博士生導(dǎo)師。

聯(lián)系方式

電子郵件：cyyneu@126.com

研究方向

1) 生物信息數(shù)據(jù)高效存儲(chǔ)與分析技術(shù)

2) 深度學(xué)習(xí)+AI賦能蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)

教育背景

2004.09-2009.07 威尼斯wnsr9778計(jì)算機(jī)軟件與理論 工學(xué)博士

2000.09-2004.07 威尼斯wnsr9778信息與計(jì)算科學(xué) 理學(xué)學(xué)士

工作履歷

2012.07-至今 威尼斯wnsr9778秦皇島分校計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專業(yè) 副教授

2009.07-2012.07 威尼斯wnsr9778秦皇島分校計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專業(yè) 講師

2011.08-2013.08 中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 博士后

學(xué)術(shù)兼職

國(guó)際期刊《BMC Bioinformatics》,《Journal of Supercomputing》,《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》等審稿人。

科研情況

現(xiàn)主持重點(diǎn)項(xiàng)目子課題1項(xiàng)。曾主持中央高?；究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)，主持國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金，博士后基金各1項(xiàng)。主持威尼斯wnsr9778秦皇島分校校內(nèi)科技支撐項(xiàng)目1項(xiàng)。曾作為主要研發(fā)人員參加科技部重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目1項(xiàng)，參加國(guó)家自然科學(xué)基金課題 5項(xiàng)，遼寧省自然科學(xué)基金和河北省自然科學(xué)基金項(xiàng)目各1項(xiàng)。參加秦皇島市科技計(jì)劃項(xiàng)目1項(xiàng)。以第一作者在SCI期刊《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》、《IEEE Transactions on Big Data》、《BMC Bioinformatics》、《Neurocomputing》、《Journal of Supercomputing》發(fā)表論文多篇。共發(fā)表論文40余篇，SCI檢索10余篇，EI檢索30余篇。發(fā)明專利1項(xiàng)。獲秦皇島市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)(二等獎(jiǎng))1次。參編教材1部。

學(xué)術(shù)成果

【代表性學(xué)術(shù)論文】

[1].Changyong Yu, Xuxian Zhou, Xinyao Chen, Haitao Ma, Yuhai Zhao. gShapeLnoc: A Graph Network Incorporating Shapelet Embedding Model for LncRNA Subcellular Localization. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2025.

[2].Changyong Yu, Dekuan Gao, Xu Guo, Haitao Ma, Yuhai Zhao Guoren Wang. dwMLCS: An Efficient MLCS Algorithm based on Dynamic and Weighted Directed Acyclic Graph. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2024. DOI: 10.1109/TCBB.2024.3431558.

[3].Changyong Yu, Yuhai Zhao, Chu Zhao, Jianyu Jin, Keming Mao, Guoren Wang. MiniDBG: a novel and minimal De Bruijn graph for Read Mapping. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023. DOI: 10.1109/TCBB.2023.3340251.

[4].Yu Changyong, Ren Tianmei, Wenyu Li, Liu Huimin, Ma Haitao and Zhao Yuhai. BL: An Efficient Index for Reachability Queries on Large Graphs, IEEE Transactions on Big Data, 2023.

[5].Yu Changyong, Liu Huimin, Fazal Wahab, Ling Zihan, Ren Tianmei, Ma Haitao and Zhao Yuhai. Global Triangle Estimation Based on First Edge Sampling in Large Graph Streams, Journal of Supercomputing. 79(13): 14079-14116 (2023).

[6].Changyong Yu, Pengxi Lin, Yuhai Zhao, Tianmei Ren, Guoren Wang: A fast and efficient path elimination algorithm for large-scale multiple common longest sequence problems. BMC Bioinform.?23(1): 366 (2022).

[7].于長(zhǎng)永， 李俊杰， 馬海濤， 趙宇海. 一種針對(duì)大規(guī)模Read Mapping的高效DBG索引方法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版）, 2023, 44(6): 770-776.

[8].Changyong Yu, Peng Liu, Yudi Liu, Haitao Ma, Yuhai Zhao. A Practical Stream data Cleaning Method based on Local Shape Feature. 2022 (Hangzhou), Asia Conference on Algorithms, Computing and Machine Learning.

[9].Yu Changyong, Zhao Yuhai, Zhao Chu, Ma Haitao and Wang Guoren. DiagAF: A More Accurate and Efficient Pre-Alignment Filter for Sequence Alignment. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, doi: 10.1109/TCBB.2021.3127879.

[10].Yu Changyong, Mao Keming, Zhao Yuhai, Chang Cheng, Wang Guoren. StLiter: A Novel Algorithm to Iteratively Build the Compacted de Bruijn Graph from Many Complete Genomes. IEEE/ACMTransactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2021, Feb 14. doi: 10.1109/TCBB.2021.3062068. 

[11].Changyong Yu, Xin Qi, Haitao Ma, Xin He, Cuirong Wang, Yuhai Zhao. LLR: Learning learning rates by LSTM for training neural networks[J]. Neurocomputing, 2020, 394.

[12].Changyong Yu, Xin He, Haitao Ma, Xin Qi, Jiarui Lu, Yuhai Zhao. S-DenseNet: A DenseNet Compression Model Based on Convolution Grouping Strategy Using Skyline Method[J]. ACCESS, 2019, 183604.

[13].于長(zhǎng)永，金建宇，劉鵬，趙宇海. 基于最小邊集的De Bruijn圖定位算法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào), 2022,43(2)，153-159.

[14].于長(zhǎng)永，王文涵，溫秀靜，趙宇海. 基于動(dòng)態(tài)雙重前綴的模糊相似性連接算法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào)，2022,43(3).

[15].馬海濤， 路家蕊， 于文鑫， 于長(zhǎng)永. 線性區(qū)域數(shù)量與PLNN表達(dá)能力的相關(guān)性[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào), 2021, 42(2): 201-207.

[16].于長(zhǎng)永，何鑫，祁欣，馬海濤. GMSDenseNet基于組多結(jié)構(gòu)卷積的輕量級(jí)DenseNet [J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào)，2020,41(1)，12-16.

[17].于長(zhǎng)永，李淼淼，趙楚，馬海濤. 一種新穎的編輯距離限制下的相似性確認(rèn)算法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào)，2019,40(11)，.1543-1548.

[18].于長(zhǎng)永，高明, 柏祿一, 趙宇海. 一種帶有長(zhǎng)度和位置約束的字符串索引方法[J]. 威尼斯wnsr9778學(xué)報(bào)，2018,39(7)，959-963.

【專利】

于長(zhǎng)永; 趙楚 ; 一種基于位運(yùn)算和SIMD并行操作的字符串過(guò)濾方法, 2024-8-2, 中國(guó), ZL 2020 1 0876431.X

講授課程情況

現(xiàn)講授計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專業(yè)《計(jì)算機(jī)數(shù)學(xué)基礎(chǔ)》和《群智能優(yōu)化技術(shù)》課程。曾經(jīng)講授計(jì)算機(jī)專業(yè)《知識(shí)發(fā)現(xiàn)與數(shù)據(jù)挖掘》、《數(shù)值分析》、《最優(yōu)化導(dǎo)論》、《并行計(jì)算》和《離散數(shù)學(xué)》等課程。

指導(dǎo)研究生情況

從2013年指導(dǎo)計(jì)算機(jī)專業(yè)研究生，目前指導(dǎo)研一、二、三學(xué)生各3人，已指導(dǎo)畢業(yè)研究生20余人。